告別怪象 生物數(shù)據(jù)利用別再“出口轉(zhuǎn)內(nèi)銷” 應(yīng)平衡共享應(yīng)用與隱私保護(hù)
“目前我國發(fā)表在國際期刊上的文章,幾乎一半與生命科學(xué)有關(guān)。要在頂級(jí)期刊發(fā)表論文,將研究數(shù)據(jù)提交給歐美幾大生物數(shù)據(jù)中心,是國際通行的做法。”中科院上海營養(yǎng)與健康研究所研究員、生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心主任李亦學(xué)初略估計(jì),多達(dá)數(shù)千TB的生物學(xué)數(shù)據(jù)目前存儲(chǔ)在國外生物數(shù)據(jù)中心,背后則是成百億元的國家科技投入。
另一個(gè)“怪象”是,通過“出口轉(zhuǎn)內(nèi)銷”,國內(nèi)同行在國際平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)了國內(nèi)難以實(shí)現(xiàn)的數(shù)據(jù)共享。
“除了缺乏共享平臺(tái),我們更缺乏共享文化。”全國人大代表、中科院上海生命科學(xué)研究院院長、中科院院士李林14日在接受科技日?qǐng)?bào)記者采訪時(shí)呼吁,我國應(yīng)建立自己的生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)管治體系。
我國生物數(shù)據(jù)利用基本是“出口轉(zhuǎn)內(nèi)銷”
“我國是名副其實(shí)的生物‘數(shù)據(jù)大國’。”李林告訴記者,自開展人類基因組研究以來,我國已產(chǎn)出大量與人類及醫(yī)學(xué)相關(guān)的基因組及其他組學(xué)研究數(shù)據(jù),僅存貯在國際基因數(shù)據(jù)庫的組學(xué)數(shù)據(jù)中,就有30%以上來自中國。
一方面是最大生物數(shù)據(jù)輸出國,另一方面我國卻嚴(yán)重依賴國際數(shù)據(jù)開展研究。
我國大量生命科學(xué)研究的基礎(chǔ)計(jì)算工作,不僅依賴國外的分析軟件,還往往依賴國外數(shù)據(jù)中心存儲(chǔ)的大規(guī)模科研數(shù)據(jù)。2006年,14條海底光纜受地震影響,中美間國際通訊受阻,國內(nèi)一時(shí)不能訪問美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)網(wǎng)站,導(dǎo)致嚴(yán)重依賴國外數(shù)據(jù)資源的我國生命科學(xué)研究受到極大影響。
李林說,我國有若干運(yùn)行較好的數(shù)據(jù)庫,但真正能夠整合大量國內(nèi)數(shù)據(jù)的公共數(shù)據(jù)庫不多,而且規(guī)模有限,基本不具備相互共享、整合并提供大規(guī)模數(shù)據(jù)服務(wù)的能力。
國內(nèi)生物數(shù)據(jù)共享文化缺乏,被認(rèn)為是造成“出口轉(zhuǎn)內(nèi)銷”現(xiàn)象的重要原因。海量的生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)散落于機(jī)構(gòu)甚至個(gè)人手中,碎片化或孤島化嚴(yán)重,狀況已持續(xù)數(shù)十年。
“在生物大數(shù)據(jù)領(lǐng)域,我國缺乏從國家層面對(duì)生物大數(shù)據(jù)進(jìn)行有效管理、利用的體制、機(jī)制和支撐環(huán)境,這已經(jīng)嚴(yán)重威脅我國生物數(shù)字主權(quán)。”李亦學(xué)在查閱國家已公布的6項(xiàng)與人類遺傳資源管理相關(guān)的行政處罰決定書后發(fā)現(xiàn),某些機(jī)構(gòu)、企業(yè)為了一己眼前利益,漠視國家管理規(guī)范,違規(guī)將大量基因資源和檢測數(shù)據(jù)輸送境外。
應(yīng)平衡共享應(yīng)用與隱私保護(hù)
“造成上述現(xiàn)象的原因很多,核心問題,是缺乏國家級(jí)公益性、規(guī)模化、權(quán)威性的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)管理創(chuàng)新服務(wù)技術(shù)體系及配套的基礎(chǔ)設(shè)施。”李林說。
2016年12月,國家發(fā)改委聯(lián)合8部門發(fā)布的《國家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施“十三五”規(guī)劃》,將“國家生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施”建設(shè)方案列入5個(gè)后備項(xiàng)目之一。
“一個(gè)人身上大約有300萬個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),隨著基因檢測技術(shù)的發(fā)展,理論上只需大概75個(gè),換言之,只需要1/40000的SNP位點(diǎn)信息,就可鎖定某個(gè)人。”李林坦言,生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的共享應(yīng)用與隱私保護(hù)相互博弈,面臨技術(shù)與倫理挑戰(zhàn)。“好比‘雞’和‘蛋’的關(guān)系,希望依托平臺(tái)建設(shè),結(jié)合國際經(jīng)驗(yàn)與我國現(xiàn)狀,建立我國生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)管治體系,從國家層面上抓落實(shí),做到既保證數(shù)據(jù)安全,又促進(jìn)共享應(yīng)用。”
按照設(shè)想,李林認(rèn)為體系包括完善基于數(shù)據(jù)安全與隱私權(quán)益的法律法規(guī)與政策標(biāo)準(zhǔn);加強(qiáng)國家數(shù)據(jù)相關(guān)管理部門與設(shè)施技術(shù)體系的合作與協(xié)同;同時(shí)要設(shè)置數(shù)據(jù)安全與倫理委員會(huì)及各級(jí)單位的信息安全部門,督導(dǎo)、引領(lǐng)并落實(shí)國內(nèi)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)安全與隱私保護(hù)。
李亦學(xué)也希望,通過平臺(tái)建設(shè),能夠慢慢培養(yǎng)國內(nèi)科研圈的科學(xué)數(shù)據(jù)共享文化。
責(zé)任編輯:孫知兵
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