華大基因家蠶超級泛基因組圖譜繪就入選2022國內(nèi)十大科技新聞

近日,由中央廣播電視總臺發(fā)布的2022年度國內(nèi)、國際十大科技新聞名單正式揭曉。其中,西南大學家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術體系首席科學家代方銀教授團隊聯(lián)合華大基因等單位合作完成的家蠶超級泛基因組項目成功入選2022年度國內(nèi)十大科技新聞。

研究團隊通過對1078份蠶種質(zhì)資源進行了深度短讀長測序,對其中545份代表性資源進行了長讀長測序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個蠶的高質(zhì)量基因組,對100個基因組進行了基因注釋,鑒定到4,300余萬個SNP、930余萬個Indel、340余萬個結構變異(SV)和7,308個新基因(家族),繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。該圖譜包含了目前全球最全面的家蠶與野桑蠶基因組信息,是全球動植物領域樣本量最大的長讀長泛基因組。此外,研究團隊在全球率先構建家蠶基因數(shù)據(jù)庫,對于開啟家蠶設計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等,將有重要深遠的意義。

華大基因千蠶高精度基因遺傳變異圖譜入選2022國內(nèi)十大科技新聞

由于家蠶可視遺傳性狀豐富,基因組大小合適,對家蠶的基因組研究將對害蟲防治等具有重要應用價值。早在2003年,日本率先開啟了家蠶基因組計劃,該計劃曾與曼哈頓原子彈計劃、阿波羅計劃并稱為20世紀三大科學計劃的國際人類基因組計劃。

作為我國基因行業(yè)的奠基者,華大基因曾助力完成人類基因組計劃1%測序工作和水稻基因組項目,擁有成熟穩(wěn)定的基因組測序能力和世界領先的組裝拼接技術。為了讓中國重新掌握桑蠶業(yè)的話語權,華大基因積極加大研發(fā)資源投入,為西南大學家蠶基因組研究團隊提供技術支持,同時在測序組裝、信息分析等方面提供專業(yè)支持。

時至今日,隨著國內(nèi)外動植物基因組研究的不斷深入,越來越多物種的泛基因組被相繼公布,泛基因組現(xiàn)已在動植物基因組學研究中被廣泛用于更為全面地評估物種內(nèi)遺傳多樣性。華大基因基于自主研發(fā)的多組學技術Stereo-seq,為研究團隊提供“亞細胞級分辨率”和“厘米級全景視場”的技術,并同時實現(xiàn)基因與影像的同時分析。憑借在動植物基因組學的研究經(jīng)驗總結,華大基因為研究團隊提供長讀長+短讀長測序結合Hi-C技術研究策略。

未來,華大基因?qū)楦嗫蒲袡C構、企事業(yè)單位等提供多組學技術支持與服務,攜手研究新興模式生物,不斷優(yōu)化升級多組學技術,為基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘提供科學支撐,助力動植物育種新突破。

免責聲明：市場有風險，選擇需謹慎！此文僅供參考，不作買賣依據(jù)。

關鍵詞：