焦點消息!廣州市八醫院捕獲XBB等變異株,華大智造為新冠變異監測提供底層工具
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隨著1月8日起我國對新型冠狀病毒實施“乙類乙管”,國內的新冠疫情防控進入了新階段,抗疫工作的重心也從“防感染”轉到“保健康、防重癥”。對于各級政府來講,穩妥有序實施“乙類乙管”是一項復雜的系統工程,面臨著新形勢和新任務。
在這一背景下,國家疾控部門進一步完善新冠病毒變異監測的工作方案,確保人民群眾的健康安全,在本土案例監測方面,每個省份都選擇了部分的城市和醫院作為監測哨點,對門診病歷、重癥和死亡病例開展一定數量的新冠病毒感染病例的采樣和序列測定。
廣州醫科大學附屬市八醫院(以下簡稱廣州市八醫院)作為“入境患者定點收治醫院”,一直動態監測新冠病毒變異的趨勢,以便能夠及時動態掌握人群感染發病水平和變化趨勢,科學研判和預測疫情規模、強度和流行時間,動態分析病毒株變異情況。
近日,廣州市八醫院基于華大智造的MGISEQ-2000基因測序儀、ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1以及MetargetCOVID軟件的測序組合,在收治的境外輸入新冠病毒感染者中檢測出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奧密克戎亞型變異毒株。
測序報告顯示測出BQ.1.25、XBB.1及XBB.2等變異毒株
據悉,華大智造MGISEQ-2000是一款靈活高效的測序平臺,搭配2種通量的載片:大載片(FCL)和小載片(FCS),可獨立上機,單次運行數據產量可從55Gb到1,440Gb;ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1則采用328對混合引物(平均擴增178bp)來捕獲新冠病毒全基因組序列信息,對于低濃度、易降解的樣本友好、具有極高的靈敏度。再配合支持批量樣本快速分析MGI MetargetCOVID軟件,可實現對新冠病毒的準確分型。
通過華大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及MetargetCOVID軟件的測序組合,廣州市八醫院能夠單次完成96*個新冠樣本的測序工作,得到病毒序列全長覆蓋率達到99%以上,測序效率高,測序結果質量優異。
事實上,早在2021年5月,華大智造就為廣州市八醫院提供新冠病毒測序工作提供工具支撐。僅在2021年5月21日至2021年6月18日不到1個月的時間里,該院就確診出159例新冠Delta毒株病例。依托華大智造的ATOPlex技術平臺和MGISEQ-2000測序儀的測序組合產品,廣州市八醫院聯合廣州醫科大學附屬第一醫院等單位成功實現對新冠Delta病毒全基因組的測序、比對、分型和溯源。
“華大智造提供的國產高通量測序工具組合準確、高效、操作簡便,為新冠病毒變異監測提供了強大的技術支撐。”廣州醫科大學附屬市八醫院傳染病研究所主任李鋒對于華大智造的測序工具組合表示了肯定。
作為國產測序儀龍頭,華大智造致力于成為“生命科技核心工具締造者”,其掌握的高通量測序技術在病原的監測和溯源以及公共衛生事件的應對中發揮著極其重要的作用。后續針對醫療機構、公共衛生機構開展新型冠狀病毒感染疫情監測的需求,華大智造實時、全景、全生命周期的測序產品組合,將持續助力病毒變異監測工作,為新階段下的防控工作貢獻一份力量。
關鍵詞: 市八醫院
責任編輯:孫知兵
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